Egy nemrég kifejlesztett aminosav alapú farmakofór módszert mutatunk be a fehérje kölcsönhatások kutatására. Aminosav alapú farmakofór módszerek hasznosak lehetnek különféle gyógyszertervezési feladatokban, például a receptor-ligand partnerek azonosításában, a fehérje kölcsönhatások szerkezeti azonosításában, a fehérje interfészek újratervezésében ligand szelektivitáshoz vagy arra, hogyan redukáljuk a kombinatorikus mutációs feltárást kisérleti fág-bemutatás kutatásban. Két kisérletesen is ellenörzött alkalmazást is bemutatunk, fehérje kölcsönhatás tervezésére.