A szomatikus genomi mutációk keletkezésének megértéséhez fontos adathalmazt szolgáltat nagy mennyiségű tumormintának az utóbbi években elvégzett teljes genom- vagy exomszekvenálása. A detektált mutációk matematikailag származtatott mintázatokba (‘COSMIC signature’) sorolhatók, melyek mögött különböző mutagenikus biológiai folyamatok állhatnak: főként DNS-károsító környezeti hatások vagy a DNS-javító folyamatok működési zavarai. A mutációs mintázatok és a DNS-hibajavítás kapcsolatainak bizonyítására teljes genomszekvenálást végeztünk izogenikus vadtípusú és génkiütött sejtvonalakon. Bizonyítottuk, hogy a homológ rekombináció hiányát pontosan mutatja az egyik tumorokból definiált bázisszubsztitúciós mintázat (signature 3). A hibás bázispárosodást javító mismatch repair hiányában is egységes mutációs spektrumot észleltünk kísérletileg, bár tumorszekvenciákban a mismatch repair hiányához 6-7 mintázatot is társítottak. Ezen ellentmondás feloldásához újraelemeztük a mismatch repair hiányos tumorgenom, tumorexom és sejttenyészetes szekvenálási adatokat, és nemnegatív mátrix faktorizáció segítségével megmutattuk, hogy két új mutációs mintázat keveréke minden esetben jól magyarázza a megfigyeléseket. A két mintázat eltérő aránya részben az exom és a genom eltérő báziseloszlásának következménye, de a talált mintázatok valószínűleg két különböző, hibás bázispárosodást okozó biológiai mechanizmushoz köthetők.
